Lo Stato Maggiore Aeronautica Virtuale (SMAV) è il principale organo di comando per quel che riguarda la vita operativa della comunità. Ha il compito di emanare direttive e regolamenti per la gestione e l'organizzazione delle risorse e dei compiti all'interno dell'Aeronautica Militare Virtuale Italiana.

Lo SMAV nomina i Comandanti degli Alti Comandi e degli altri reparti, approva e sviluppa attività di volo operative ed addestrative e supervisiona e se necessario gestisce le relazioni verso l'esterno. Inoltre, in caso di necessità può fare le veci di qualsiasi altro comando ad esso subordinato.

Lo SMAV svolge attività di controllo su ogni aspetto dell'Aeronautica Militare Virtuale Italiana e verifica l'adottamento dei regolamenti e delle direttive emanate.